Jueves

Combate el SIDA en casa, usando tu tiempo computacional disponible en la comodidad de tu hogar

World Community Grid está ayudando a "FightAIDS@home" a completar los cálculos computacionales relacionados con las estructuras moleculares de potenciales drogas anti-VIH. Crédito de Imagen: World Community Grid

World Community Grid está ayudando a "FightAIDS@home" a completar los cálculos computacionales relacionados con las estructuras moleculares de potenciales drogas anti-VIH. Crédito de Imagen: World Community Grid

Con el comienzo del Día Mundial del SIDA el próximo 1 de Diciembre, World Community Grid auspiciará un desafío de un mes de duración a través de su proyecto FightAIDS@home, con la meta de incrementar el número de ciclos computacionales disponibles para los investigadores que llevan a cabo la investigación VIH/SIDA.

Como todas las moléculas, el virus del VIH que causa el SIDA es dependiente de sus formas tridimensionales para atacar el sistema inmunitario humano, de la misma forma que una llave debe encajar en la cerradura para poder entrar. Si esa cerradura puede ser bloqueada con una droga, entonces la llave no puede entrar, y se evita que el virus madure. Tales sistemas de bloqueo, conocidos como “inhibidores de proteasa”, son una forma de evitar el comienzo del SIDA.

Los investigadores han podido determinar a base de prueba y error las formas de una “cerradura” y su “llave” en forma separada, pero no siempre para los dos juntos. Si los científicos supieran como una molécula de la droga encaja dentro del sitio activo de su objetivo, los químicos podrían ver como diseñar un mejor sistema de bloqueo, más potente que los ya existentes.

En el laboratorio de Arthur Olson en el Departamento Molecular de Biología en el Instituto The Scripps Research  en la Jolla, California, los métodos computacionales están siendo usados para identificar los nuevos candidatos para drogas que con la forma correcta y las características químicas para bloquear el VIH. Conocido como “El diseño de droga basado en una Estructura” (“Structure-Based Drug Design”), este acercamiento requiere vastos recursos computacionales. (Para hacer las cosas más desafiantes, el VIH está constantemente evolucionando a nuevas variantes, algunas de las cuales son resistentes a las drogas ya existentes. En consecuencia, los científicos deben buscar continuamente una droga nueva y mejor para dar en el blanco de su objetivos que se mueve muy rápido).

Una dirección diferente

Para tratar estos desafíos, el proyecto FihtAIDS@home usa un programa llamado AutoDock desarrollado en el laboratorio Olson. AutoDock es una serie de herramientas que predicen que tan pequeñas son las moléculas, tales como los candidatos a ciertas drogas, que pueden unirse o “acoplarse” a un receptor de la estructura 3D ya conocida.

Un modelo físico tangible, y tridimensional de la proteasa del VIH, un objetivo para la terapia del SIDA. Los científicos en Scripps utilizan estos tipos de modelso para ayudar a diseñar nuevos candidatos para drogas que puedan ser robustas en contra de la resistencia del virus. Crédito de imagen: BioMedical Graphics y el Laboratorio de Arthur Olson

Un modelo físico tangible, y tridimensional de la proteasa del VIH, un objetivo para la terapia del SIDA. Los científicos en Scripps utilizan estos tipos de modelso para ayudar a diseñar nuevos candidatos para drogas que puedan ser robustas en contra de la resistencia del virus. Crédito de imagen: BioMedical Graphics y el Laboratorio de Arthur Olson

Con la ayuda de World Community Grid (una organización de computación distribuida pública y filantrópica) comenzaron con un gigante computacional IBM en Noviembre de 2004 con cientos de miles de voluntarios que hasta el momento han dona más de 84.000 años de tiempo computacional para sus investigadores en todo el mundo.

La computación en red junta muchos computadores individuales, creando un gran sistema con poder computacional masivo que sobrepasa por lejos de varios supercomputadores. Debido a que su trabajo es divido en pequeñas piezas que pueden ser procesadas simultáneamente, el tiempo de investigación es reducido de años a meses o incluso días.

De acuerdo a UNAIDS – El programa de las Naciones Unidas en VIH/SIDA, hay ahora 33.2 millones de personas viviendo con VIH, incluyendo 2.5 millones de niños. Alrededor de la mitad de aquellos infectados con VIH son antes de los 25, y mueren por el SIDA antes de sus 35.

Si ya perteneces a World Community Grid, todo lo que necesitas hacer para participar es hacer click en esta dirección web y luego clickear el botón “Join Now”.

Sitio web Oficial: FightAIDS@home

Autor: Dan Drollette, iSGTW
Fuente: ISGTW
Traducción: Tiare Rivera para Seti.cl
Fecha Original: 26 de Noviembre 2008